Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
HECW1Q76N89 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
HECW1Q76N89 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms