Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms