Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms