Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms