Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZCCHC12Q6PEW1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms