Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6P435 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6P435 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6P435 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6P435 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6P435 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6P435 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6P435 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6P435 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6P435 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6P435 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6P435 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6P435 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms