Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms