Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms