Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms