Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIE3

VWA5B1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B1Q5TIE3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA5B1Q5TIE3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms