Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms