Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms