Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SAMD9Q5K651 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SAMD9Q5K651 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms