Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms