Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCTE1Q5JU00 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TCTE1Q5JU00 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms