Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMER1Q5JTC6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMER1Q5JTC6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AMER1Q5JTC6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMER1Q5JTC6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AMER1Q5JTC6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms