Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms