Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms