Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM3Q53FZ2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms