Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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