Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED5Q49AG3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZBED5Q49AG3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms