Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms