Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms