Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms