Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FHOD3Q2V2M9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms