Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms