Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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CDO1Q16878 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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