Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTC4SQ16873 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms