Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME3Q16798 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ME3Q16798 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ME3Q16798 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ME3Q16798 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ME3Q16798 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ME3Q16798 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ME3Q16798 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME3Q16798 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME3Q16798 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME3Q16798 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME3Q16798 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME3Q16798 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ME3Q16798 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME3Q16798 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME3Q16798 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME3Q16798 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME3Q16798 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME3Q16798 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME3Q16798 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME3Q16798 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ME3Q16798 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME3Q16798 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME3Q16798 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME3Q16798 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME3Q16798 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME3Q16798 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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