Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIST3H3Q16695 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIST3H3Q16695 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIST3H3Q16695 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIST3H3Q16695 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIST3H3Q16695 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIST3H3Q16695 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HIST3H3Q16695 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIST3H3Q16695 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIST3H3Q16695 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIST3H3Q16695 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIST3H3Q16695 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIST3H3Q16695 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms