Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMCHL1Q16048 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PMCHL1Q16048 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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PMCHL1Q16048 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PMCHL1Q16048 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PMCHL1Q16048 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PMCHL1Q16048 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PMCHL1Q16048 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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