Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKBIBQ15653 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms