Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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