Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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