Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms