Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms