Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTTNQ14247 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTTNQ14247 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms