Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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