Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE1CQ14123 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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