Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF1Q13972 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms