Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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