Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms