Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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CDH18Q13634 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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CDH18Q13634 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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