Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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TUBB3Q13509 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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TUBB3Q13509 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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