Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms