Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
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TCOF1Q13428 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCOF1Q13428 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
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TCOF1Q13428 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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TCOF1Q13428 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
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