Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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