Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIGQ13278 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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