Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms