Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 ANXA2-226ENST00000559818 878 ntTSL 515.4■□□□□ 0.068e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.058e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 XIAP-211ENST00000497906 495 ntTSL 515.19■□□□□ 0.028e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 CDC42SE1-205ENST00000491825 837 ntTSL 215.1■□□□□ 0.018e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 PFKFB4-215ENST00000496767 779 ntTSL 515.06■□□□□ 07e-11■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 TRAPPC12-203ENST00000411973 838 ntTSL 515.01□□□□□ -0.018e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.018e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 MTMR3-207ENST00000445401 665 ntTSL 314.98□□□□□ -0.018e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 SEC24D-208ENST00000506622 1319 ntTSL 214.93□□□□□ -0.028e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 PFKFB4-206ENST00000422701 636 ntTSL 314.88□□□□□ -0.037e-11■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 TBCD-216ENST00000574886 883 ntTSL 514.83□□□□□ -0.048e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 DOCK8-217ENST00000524396 2206 ntTSL 514.82□□□□□ -0.048e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.058e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 PRPS2-201ENST00000380663 584 ntTSL 414.69□□□□□ -0.068e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.068e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.088e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 CRELD1-209ENST00000482691 690 ntTSL 314.52□□□□□ -0.098e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 CDC42SE1-203ENST00000470278 939 ntTSL 514.44□□□□□ -0.18e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.18e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.118e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.148e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.157e-11■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 XIAP-206ENST00000468503 157 ntTSL 313.94□□□□□ -0.188e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.188e-6■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.198e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 CRELD1-205ENST00000435417 966 ntTSL 513.8□□□□□ -0.28e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 TPCN2-207ENST00000637084 4622 ntTSL 1 (best)13.77□□□□□ -0.218e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 ARRB1-203ENST00000524400 593 ntTSL 413.67□□□□□ -0.228e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.238e-6■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 EPS15L1-208ENST00000595845 567 ntTSL 213.47□□□□□ -0.258e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.268e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 CRELD1-210ENST00000489674 437 ntTSL 513.42□□□□□ -0.268e-6■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.298e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 PFKFB4-203ENST00000412035 567 ntTSL 413.1□□□□□ -0.317e-11■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 TXNRD2-216ENST00000495655 2700 ntTSL 213□□□□□ -0.338e-6■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 SDHD-211ENST00000525987 968 ntTSL 412.75□□□□□ -0.378e-6■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 IFT122-232ENST00000515783 962 ntTSL 512.59□□□□□ -0.398e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.428e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 CRELD1-208ENST00000467713 540 ntTSL 212.44□□□□□ -0.428e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 TBCD-224ENST00000576760 1059 ntTSL 512.4□□□□□ -0.428e-6■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 IFT122-220ENST00000509815 422 ntTSL 512.39□□□□□ -0.438e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 PIAS2-210ENST00000589917 561 ntTSL 512.22□□□□□ -0.458e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 ANXA2-211ENST00000558169 557 ntTSL 412.08□□□□□ -0.488e-6■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 ANXA2-224ENST00000559725 561 ntTSL 411.89□□□□□ -0.518e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.528e-6■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.538e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 LINC00923-201ENST00000503768 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.538e-6■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 RFC3-201ENST00000380071 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.578e-6■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 ZNF678-203ENST00000440339 798 ntTSL 211.22□□□□□ -0.618e-6■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 RNF144A-203ENST00000432850 805 ntTSL 311.01□□□□□ -0.658e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 TBCD-213ENST00000574422 879 ntTSL 210.98□□□□□ -0.658e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 EFTUD2-202ENST00000426333 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.688e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 TBCD-215ENST00000574818 771 ntTSL 310.77□□□□□ -0.698e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 ARRB1-211ENST00000533255 551 ntTSL 210.69□□□□□ -0.78e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 AC114490.2-201ENST00000487874 3099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.78e-6■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 TBCD-217ENST00000574975 867 ntTSL 510.43□□□□□ -0.748e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 RFWD2-203ENST00000367667 2034 ntTSL 1 (best)10.36□□□□□ -0.758e-6■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 PIAS2-208ENST00000587810 447 ntTSL 510.27□□□□□ -0.778e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 ANXA2-214ENST00000558985 780 ntTSL 210.19□□□□□ -0.788e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 IFT122-215ENST00000507564 3824 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.88e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 IFT122-203ENST00000348417 3877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.88e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 CDC42SE1-207ENST00000540998 3181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.838e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 DNHD1-202ENST00000354685 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.838e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 IFT122-205ENST00000431818 4414 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.848e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 DOCK8-214ENST00000487230 537 ntTSL 49.54□□□□□ -0.888e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 CDC42SE1-202ENST00000439374 3498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.898e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 ANXA2-238ENST00000561445 514 ntTSL 59.47□□□□□ -0.898e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 ANXA2-233ENST00000560468 663 ntTSL 59.47□□□□□ -0.898e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 IFT122-210ENST00000504021 3541 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.898e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 PIAS2-214ENST00000592011 1394 ntTSL 1 (best)9.46□□□□□ -0.98e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 DNHD1-203ENST00000472080 2288 ntTSL 29.45□□□□□ -0.98e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 ZNF678-205ENST00000608949 929 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.98e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 IFT122-225ENST00000512220 4057 ntTSL 29.4□□□□□ -0.98e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 SEC24D-201ENST00000280551 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.918e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 ANXA2-203ENST00000421017 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.938e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 PRPS2-204ENST00000461630 891 ntTSL 1 (best)9.21□□□□□ -0.948e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 ANXA2-227ENST00000559956 558 ntTSL 59.2□□□□□ -0.948e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 ANXA2-225ENST00000559780 802 ntTSL 39.18□□□□□ -0.948e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 ANXA2-209ENST00000557986 733 ntTSL 59.18□□□□□ -0.948e-6■■■□□ 18.9
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